CNAS秘书处是CNAS的常设机构，负责CNAS认可工作的具体运作。主要职责是： a.执行全体委员会的决议，并向全体委员会报告工作； b.编制认可规则、准则和指南等认可工作的公开文件； c.制订和实施内部管理体系文件； d.签订与外部机构的协议； e.受理认可申请，组织认可评审，签发认可证书，实施认可后续监督； f.受理认可申诉，处理认可投诉； g.开展认可相关的其他活动。
CNAS认可流程： 第1步：前期规划：实验室建设、仪器采购校准、人员招聘与培训、质量手册、程序文件的编制及审核定稿、实验室质量体系诊断及检测水平评估等。 第2步：建立体系：按照CNAS相关领域要求、认可准则要求等，建立起符合自己实验室现状的管理体系，并有效运行。 第3步：网上申请：登录CNAS网站：，填写实验室认可申请，按照要求上传附件，确认无误后提交。 第4步：文件审查：CNAS评审组会对材料进行文件审查，可能会指出不合理或者有疑惑的地方，需要进行补正。 第5步：预约评审：CNAS会安排评审组长和评审员，对实验室进行现场评审。 第6步：现场评审：评审老师会带着样品及盲样来到现场，进行观察实验。 第7步：整改验收：需要时，不符合项的整改验收。 第8步：批准发证：评定，批准，颁发认可证书。 第9步：后续工作：获得实验室CNAS认可后的监督和复评审。
申请认可的实验室应依据CNAS-CL01：2018 《检测和校准实验室能力的通用要求》(ISO/IEC17025 ： 2017)建立、实施和维持与其活动范围相适应的质量体系。应将其政策、制度、计划、程序和指导书制订成文件，并达到确保实验室检测和（或）校准结果质量所需的程度。这是一项系统工程，要经过标准的学习、质量体系策划。质量体系文件编制、质量体系运行、内审员的培训、质量体系内部审核、质量体系模拟评审等过程，确保质量体系持续有效的运行，终通过实验室国家认可委的现场评审，获取实验室认可证书。
CNAS认证的作用意义： 1.表明具备按照相应认可标准开展检测校准服务的技术能力； 2.增强市场竞争力，赢得政府部门，社会各界的信任； 3.获得签订互认协议的国家和地区认可机构的认可； 4.有机会参与国际间台格评估机构的认可，多边合作交流； 5.可在认可范围内使用CNAS国家实验室认可标志和标志IAC国际互认联合标志； 6.列入获准认可机构名单，提高知名度。